Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MICAL3Q7RTP6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MICAL3Q7RTP6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms