Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HS2ST1Q7LGA3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms