Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
XIRP1Q702N8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
XIRP1Q702N8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms