Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDZRN4Q6ZMN7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms