Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCBE1Q6UXH8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCBE1Q6UXH8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms