Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SUSD1Q6UWL2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms