Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ANKRD40Q6AI12 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms