Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATG16L1Q676U5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG16L1Q676U5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms