Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USPL1Q5W0Q7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
USPL1Q5W0Q7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms