Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PERM1Q5SV97 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PERM1Q5SV97 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms