Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHYHD1Q5SRE7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms