Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC158Q5M9N0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC158Q5M9N0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms