Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ZNF628Q5EBL2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ZNF628Q5EBL2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms