Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TDRD12Q587J7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TDRD12Q587J7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms