Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS7

GLE1, Nucleoporin GLE1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLE1Q53GS7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLE1Q53GS7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GLE1Q53GS7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms