Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PKDCCQ504Y2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDCCQ504Y2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms