Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A4Q4VNC1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP13A4Q4VNC1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms