Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFAP221Q4G0U5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP221Q4G0U5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms