Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RNF212Q495C1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RNF212Q495C1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms