Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY84

KRT71, Keratin, type II cytoskeletal 71, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT71Q3SY84 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KRT71Q3SY84 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KRT71Q3SY84 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms