Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC4A8Q2Y0W8 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A8Q2Y0W8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms