Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GEN1Q17RS7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GEN1Q17RS7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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