Protein–RNA interactions for Protein: Q17RC7

EXOC3L4, Exocyst complex component 3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOC3L4Q17RC7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EXOC3L4Q17RC7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOC3L4Q17RC7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms