Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HADHQ16836 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HADHQ16836 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HADHQ16836 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HADHQ16836 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHQ16836 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHQ16836 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHQ16836 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHQ16836 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHQ16836 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHQ16836 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HADHQ16836 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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