Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DDR2Q16832 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DDR2Q16832 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms