Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLPPQ16740 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CLPPQ16740 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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