Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP2B3Q16720 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATP2B3Q16720 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP2B3Q16720 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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