Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NFE2Q16621 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFE2Q16621 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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