Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CTF1Q16619 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTF1Q16619 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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