Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATP6AP1Q15904 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATP6AP1Q15904 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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