Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CST6Q15828 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CST6Q15828 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CST6Q15828 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CST6Q15828 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CST6Q15828 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CST6Q15828 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CST6Q15828 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CST6Q15828 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CST6Q15828 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CST6Q15828 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms