Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYCP1Q15431 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYCP1Q15431 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
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