Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SF3A2Q15428 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SF3A2Q15428 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms