Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBE3CQ15386 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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