Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
IRF4Q15306 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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