Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
PTPRKQ15262 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PTPRKQ15262 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
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