Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPAQ15257 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPAQ15257 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
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