Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PCOLCEQ15113 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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