Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM2Q15035 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM2Q15035 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
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