Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
GAPVD1Q14C86 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GAPVD1Q14C86 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
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