Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHPRHQ149N8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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