Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NWD1Q149M9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NWD1Q149M9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NWD1Q149M9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms