Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIXQ14938 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIXQ14938 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms