Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM29Q14134 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM29Q14134 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
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