Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PKP1Q13835 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PKP1Q13835 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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