Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APOFQ13790 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
APOFQ13790 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
APOFQ13790 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
APOFQ13790 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
APOFQ13790 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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