Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CACNA1SQ13698 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNA1SQ13698 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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