Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTCH1Q13635 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PTCH1Q13635 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTCH1Q13635 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
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