Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
KRR1Q13601 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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