Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRF5Q13568 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRF5Q13568 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
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